Dalis moterų sako pastebinčios, kad migrena stiprėja dėl kontraceptinių tablečių. Tai paprastai tinka estrogeno ir progesterono deriniams, kurie didesnę estrogeno koncentraciją išlaiko tris kiekvieno mėnesio savaites. Nustojus vartoti tabletes, hormonų koncentracija greitai mažėja ir prasideda kraujavimas. Šis ryšys galioja visiems migreniniams skausmams (tiek su aura, tiek be jos).
Daug epidemiologinių duomenų pagrindžia kombinuotųjų kontraceptinių tablečių ir migrena su aura sergančių moterų (ypač rūkančių) insulto sąsają. Dauguma gydytojų mano, kad tokiomis aplinkybėmis kombinuotųjų kontraceptinių tablečių vartojimas yra kontraindikuotinas. Neatlikta jokių sisteminių progesterono kontraceptinių tablečių įtakos migrenai tyrimų. Šie vaistai nesukelia trombų susidarymo rizikos, todėl negalima sakyti, kad jie visiškai kontraindikuotini migrena su aura sergančioms pacientėms.