Daug suaugusių moterų teigia, kad galvos skausmas dažniausiai prasideda ir sustiprėja prieš menstruacijas arba per jas. Dalis priepuolius patiria tik per menstruacijas. Kai kurioms tenka paaiškinti, kad galvos skausmas nėra neišvengiamas menstruacijų palydovas. Atliekant naujausius tyrimus Italijoje buvo lyginti klinikiniai menstruacine migrena sergančių moterų simptomai ir atsakas į gydymą menstruacijų dienomis ir ne menstruacijų dienomis. Rezultatai parodė, kad migrenos priepuoliai, įvykę pirmas 2 ciklo dienas, yra ilgesni, stipresni ir sunkiau malšinami vaistais negu su menstruacijomis nesusiję, kuriuos patiria su menstruacijomis susijusia migrena sergančios moterys. Yra aiškių įrodymų, kad galvos skausmo priepuolius sukelia sumažėjusi estrogeno koncentracija. Didelės papildomo estrogeno dozės menstruacijų ciklo pabaigoje atitolina menstruacijas ir su jomis susijusį galvos skausmą (5.1 pav.). Daliai pacienčių padėjo estrogeno dozė prieš vieną arba prieš dvi dienas iki menstruacijų. Šiuo atveju estrogeno koncentracija mažėja palengva ir gali įvykti menstruacijos. Su retomis išimtimis migrenos priepuoliai susilpnėja esant nėštumui, ypač po pirmojo trimestro, nes hormonų koncentracija stabilizuojasi. Tačiau priepuolių dažnai pasitaiko pirmą savaitę po gimdymo, nes sparčiai mažėja estrogeno koncentracija.